Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

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Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Spta1P08032 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Spta1P08032 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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