Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtrP07309 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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TtrP07309 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TtrP07309 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TtrP07309 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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