Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06344 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06344 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P06344 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
P06344 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
P06344 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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P06344 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
P06344 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
P06344 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms