Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb1P04202 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb1P04202 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms