Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01809 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01809 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01809 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01809 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01809 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01809 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01809 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms