Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01740 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01740 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01740 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01740 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01740 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01740 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01740 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01740 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01740 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms