Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01647 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01647 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01647 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01647 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01647 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms