Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifnb1P01575 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifnb1P01575 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms