Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Casp8O89110 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms