Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
JtbO88824 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
JtbO88824 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
JtbO88824 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms