Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hcn2O88703 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hcn2O88703 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms