Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ClppO88696 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ClppO88696 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ClppO88696 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClppO88696 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClppO88696 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ClppO88696 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ClppO88696 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ClppO88696 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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