Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pak1O88643 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pak1O88643 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms