Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col5a1O88207 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col5a1O88207 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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