Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtssO70370 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtssO70370 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtssO70370 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtssO70370 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtssO70370 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms