Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Sigmar1O55242 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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