Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ptpn20O55082 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ptpn20O55082 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ptpn20O55082 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms