Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NmbrO54799 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NmbrO54799 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms