Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CrxO54751 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
CrxO54751 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
CrxO54751 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
CrxO54751 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms