Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EdaO54693 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EdaO54693 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EdaO54693 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EdaO54693 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EdaO54693 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EdaO54693 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EdaO54693 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EdaO54693 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EdaO54693 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms