Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cited2O35740 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cited2O35740 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms