Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn1mwO35599 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms