Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Slc18a3O35304 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms