Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hps1O08983 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hps1O08983 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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