Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
IfnabL7MTU6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms