Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccer2J3QPU5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccer2J3QPU5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms