Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm11236J3QMS7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm11236J3QMS7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm11236J3QMS7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms