Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms