Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm29394H3BIW7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm29394H3BIW7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms