Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Vmn1r34G3XA52 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms