Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf148G3X9R7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms