Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hmgxb3G3X9M3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms