Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Srp72F8VQC1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Srp72F8VQC1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Srp72F8VQC1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Srp72F8VQC1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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