Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp9yF8VPU6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Usp9yF8VPU6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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