Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm17555F6U8B9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17555F6U8B9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms