Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
BC030500E9Q6W0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
BC030500E9Q6W0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms