Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BC005561E9Q5E2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BC005561E9Q5E2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms