Protein–RNA interactions for Protein: E9Q501

Gm2237, Predicted gene 2237, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2237E9Q501 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm2237E9Q501 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms