Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrp3E9Q1T6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lrp3E9Q1T6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lrp3E9Q1T6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lrp3E9Q1T6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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