Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Brd1E9PZ26 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms