Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trappc8E9PWG2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trappc8E9PWG2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms