Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms