Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm5934D3Z4U6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm5934D3Z4U6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms