Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ptrhd1D3Z4S3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms