Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
9630041A04RikD3Z3U4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
9630041A04RikD3Z3U4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms