Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5930D3Z257 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms