Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rexo5D3YW29 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rexo5D3YW29 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms