Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mfap1bC0HKD9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mfap1bC0HKD9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms