Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmf1B9EKI3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms