Protein–RNA interactions for Protein: B2RV46

Spata6l, Spermatogenesis associated 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata6lB2RV46 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Spata6lB2RV46 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms